一、擴增曲線不穩(wěn)定
可能原因
RNA純度低;體系中存在較多雜質(zhì);儀器使用時間過長。
解決方案
1)提取高純度的RNA,小心操作。
2)對儀器進行校準(zhǔn)。
二、擴增無法達到平臺期
可能原因
模板濃度太低;循環(huán)數(shù)太少;試劑擴增效率低。
解決方案
1) 提高模板量
2) 提高循環(huán)數(shù)
3) 用標(biāo)準(zhǔn)曲線測定擴增效率,提高鎂離子濃度,換用擴增效率高的試劑。
三、熒光下降
可能原因
存在降解;模板濃度過高。
解決方案
1) 提高體系純度
2) 降低模板量
3) 降低熒光閾值
四、單峰、峰不尖銳
可能原因
與試劑成分有關(guān);或存在大小相近的非特異性擴增。
解決方案
1) 溫度跨度不高于7度,視為可用結(jié)果
2) 進行高濃度瓊脂糖電泳,確認是否為單一條帶。
五、單峰,Tm低于80度
可能原因
只有引物二聚體,無目的條帶;或擴增片段過短。
解決方案
1) 檢查是否加入模板
2) 進行瓊脂糖電泳檢測,確定條帶大小是否正確
六、雙峰,較低峰Tm在80度之前
可能原因
由于模板濃度過低或引物濃度過高使多余引物形成引物二聚體。
解決方案
1) 適當(dāng)提高退火溫度
2) 提高模板量,降低引物濃度
3) 重新設(shè)計引物。
七、qPCR注意事項
·提高樣品純度,盡量減少樣品之間的交叉污染。
·每個樣品至少要做3個平行孔,以防在 后面的數(shù)據(jù)分析中,由于Ct相差較多或者SD太大,無法進行統(tǒng)計分析。
·MasterMix不要反復(fù)凍融,如果經(jīng)常使用,最好融解后放 在4℃;配置體系時在冰上操作;減少加樣誤差,每管或每孔都要換新槍頭,不要連續(xù)用同一個槍頭加樣;所有成分加完后,離心去除氣泡。
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